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自清洗過濾器而外酶的水解作用是比較緩慢的

對于不溶性有機物，先要通過外酶的作用，成為溶解性有機物后，才能進行酸性和堿性發酵。自清洗過濾器而外酶的水解作用是比較緩慢的，因此固體物質在進行厭氧處理1之前應盡量使其粉碎或打成小塊。1967年，Bryant報告認為對于不溶性有機物，消化經歷四個階段：先是水解階段，固態有機物被細菌的胞外酶所水解；第二階段是酸化；在進入甲烷化階段之前，代謝中間液態產物都要乙酸化，稱乙酸化階段；第  ，四階段是甲烷化階段。然而甲烷化效率很高的甲烷八疊球菌能夠代謝甲醇，乙和C02為甲烷。
厭氧消化中，產乙酸細菌和產甲烷細菌之間有復雜和嚴格的共生關系，自清洗過濾器只有保持一種平衡狀態才能有效完成有機物的全部轉化過程，復雜有機物的絕大部分(72%的COD)是經過乙酸再生成甲烷的。脫硫弧菌（硫酸還原細菌）也具有與產乙酸細菌相類似的作用，能將乳酸、丙酮酸和乙醇轉化為Hz、C02和乙酸。但在含硫無機物存在，它將優先還原sq—、S02-，產生H2S，形成與甲烷細時基質的競爭。因此，當厭氧處理系統中s戊—、SO：-濃度過高時，產甲烷過程就會受到抑制。消化氣中C02成分提高，并含有較多的H2S。反過來H2S對甲烷菌的毒害作用更進一步影響整個系統的正常工作。因此在工程實際應用上，研究甲烷細菌的通性是重要的，這將有助于打破厭氧生物處理過程分階段的現象，從而最大限度地縮短處理過程的歷時。
細菌是專性厭氧的。自清洗過濾器目前已從純培養中分離出數十種甲烷細菌。它們在形態上有明顯的差別，但在細胞壁的結構方面有許多相似之處。值得提出的是甲八疊球菌，它的效率高，能利用甲醇、乙酸和C02作為基質。與產酸菌相比，甲烷細菌對溫度、pH值、有毒物質等更為敏感。
 

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